Ce projet se fonde sur l’utilisation de la technologie
des lames virtuelles (images de la préparation histologique
entière) acquises au scanner numérique ou au
microscope automatique. Il s’appuie sur une collaboration
pluridisciplinaire établie entre des chercheurs en
traitement d’images (LUSAC) et des pathologistes, cliniciens
et biologistes (Laboratoire d’Anatomo-Pathologie –
CRLCC F. Baclesse, GRECAN). C’est une nouvelle dimension
donnée au document histologique, jusqu’alors
limité à quelques images de champs microscopiques,
qui peut désormais être analysé dans son
ensemble et/ou par régions d’intérêt.
Il consiste à développer des outils informatiques
d'aide à l'apprentissage et à l'évaluation
du diagnostic histopathologique selon trois volets :
- Constitution d'une base d'images architecturées conséquente,
continuellement en phase d’enrichissement et facilement
consultable en ligne ; le travail porte actuellement sur l’étude
de 246 cas de cancers du sein classés en 27 familles.
- Mise en place d'un outil interactif d'apprentissage et d'évaluation
; il propose aux pathologistes des images extraites de la
base sur lesquelles ils doivent porter un diagnostic qui sera
confronté à celui des experts de la localisation.
Cet outil est facile à utiliser et consultable sur
internet car créé en PHP et HTML.
- Développement d’un système d’aide
au diagnostic ; mise au point de méthodes d'indexation
d'images couleur, pour proposer automatiquement des éléments
de diagnostic sur une nouvelle image, par référence
à la base de connaissances.
En ce qui concerne le 3ème volet, la première
étape de cette indexation de la base porte sur les
caractéristiques globales des images et leur distribution
couleur, ce qui va permettre une pré-classification.
Cette pré-classification sera ensuite affinée
par l’étude des paramètres locaux provenant
de la segmentation des amas cellulaires tumoraux, puisque
les différentes familles ont des caractéristiques
de forme, de couleur ou de texture des amas différentes.
Une interface complète, adaptable à d’autres
pathologies, est d’ores et déjà réalisée.
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