Indexation d'images histopathologiques

 

Ce projet se fonde sur l’utilisation de la technologie des lames virtuelles (images de la préparation histologique entière) acquises au scanner numérique ou au microscope automatique. Il s’appuie sur une collaboration pluridisciplinaire établie entre des chercheurs en traitement d’images (LUSAC) et des pathologistes, cliniciens et biologistes (Laboratoire d’Anatomo-Pathologie – CRLCC F. Baclesse, GRECAN). C’est une nouvelle dimension donnée au document histologique, jusqu’alors limité à quelques images de champs microscopiques, qui peut désormais être analysé dans son ensemble et/ou par régions d’intérêt.


Il consiste à développer des outils informatiques d'aide à l'apprentissage et à l'évaluation du diagnostic histopathologique selon trois volets :
- Constitution d'une base d'images architecturées conséquente, continuellement en phase d’enrichissement et facilement consultable en ligne ; le travail porte actuellement sur l’étude de 246 cas de cancers du sein classés en 27 familles.
- Mise en place d'un outil interactif d'apprentissage et d'évaluation ; il propose aux pathologistes des images extraites de la base sur lesquelles ils doivent porter un diagnostic qui sera confronté à celui des experts de la localisation. Cet outil est facile à utiliser et consultable sur internet car créé en PHP et HTML.
- Développement d’un système d’aide au diagnostic ; mise au point de méthodes d'indexation d'images couleur, pour proposer automatiquement des éléments de diagnostic sur une nouvelle image, par référence à la base de connaissances.

En ce qui concerne le 3ème volet, la première étape de cette indexation de la base porte sur les caractéristiques globales des images et leur distribution couleur, ce qui va permettre une pré-classification.
Cette pré-classification sera ensuite affinée par l’étude des paramètres locaux provenant de la segmentation des amas cellulaires tumoraux, puisque les différentes familles ont des caractéristiques de forme, de couleur ou de texture des amas différentes.
Une interface complète, adaptable à d’autres pathologies, est d’ores et déjà réalisée.




Date de dernière modification du site : 27 janvier 2009
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